वर्तमान संस्थान साढे चार वर्ष (छः महीने इंटर्रशिप) का फिजियोथेरापी (बीपीटी) पाठ्यक्रम 62 अंतर्ग्रहण सह चलाता है । दो वर्षीय मास्टर्स पाठ्यक्रम फिजियोथेरापी (एम.पी.टी) 15 अंतर्ग्रहण सहित चलाता है । एमपीटी में विशेषज्ञता ङङ्गपुनर्स्थापन' और मस्कुलोस्केलेटन कंडिशन शिशुरोग चिकित्सा एवं ङङ्गस्नायुरोग के लिए उपलब्ध हैं । बीपीटी पाठ्यक्रमों में 2008 प्रवेश वाले एवं 2009 परीक्षा के लिए सेमिस्टर पद्धति लागू हो चुकी है ।